借款超过三年起诉时效借条还有效。借条只是证明双方存在借款关系的证据，不会因为时间的长短而失去证明效力。
但是债权人超过三年没有主张权利的就过了诉讼时效，但是债权人依然可以向法院提起诉讼，只要债务人没有提出诉讼时效抗辩，债权人就不会失去胜诉权。
【法律依据】
《民事诉讼法》第一百一十九条，起诉必须符合下列条件：
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
(二)有明确的被告；
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由；
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
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